Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms