Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms