Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAVER2Q9HCJ3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAVER2Q9HCJ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms