Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms