Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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