Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms