Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms