Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPATA9Q9BWV2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms