Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LPIN3Q9BQK8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LPIN3Q9BQK8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LPIN3Q9BQK8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms