Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FRMD6Q96NE9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms