Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMTD1Q96MG8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms