Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms