Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms