Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms