Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVB12AQ96EY5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms