Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms