Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPTQ96BT3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms