Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER1Q8TDN7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms