Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCER1Q8TC90 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER1Q8TC90 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms