Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms