Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX2

SLC17A8, Vesicular glutamate transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A8Q8NDX2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A8Q8NDX2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC17A8Q8NDX2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC17A8Q8NDX2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC17A8Q8NDX2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A8Q8NDX2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A8Q8NDX2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A8Q8NDX2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A8Q8NDX2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A8Q8NDX2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A8Q8NDX2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms