Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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