Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTROBQ8N137 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTROBQ8N137 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms