Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms