Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP13Q86W25 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP13Q86W25 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms