Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms