Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDXQ7Z353 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms