Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP12Q6UXS9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms