Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms