Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms