Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms