Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms