Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms