Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms