Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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