Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms