Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRTAP24-1Q3LI83 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms