Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF4Q2M2E3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms