Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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