Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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FXNQ16595 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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FXNQ16595 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FXNQ16595 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FXNQ16595 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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