Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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