Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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