Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TWIST1Q15672 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms