Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRLQ15198 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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