Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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