Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms