Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CBX2Q14781 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX2Q14781 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms