Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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