Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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ERV3-1Q14264 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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ERV3-1Q14264 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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ERV3-1Q14264 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERV3-1Q14264 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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