Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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ITGA9Q13797 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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ITGA9Q13797 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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ITGA9Q13797 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGA9Q13797 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ITGA9Q13797 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ITGA9Q13797 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ITGA9Q13797 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ITGA9Q13797 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ITGA9Q13797 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ITGA9Q13797 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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ITGA9Q13797 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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ITGA9Q13797 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA9Q13797 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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